Periódicamente se realizan monitoreos en el espejo de agua del Valle de Punilla. Estos estudios están a cargo de personal del Laboratorio de Calidad de Agua, que recorre distintos puntos del embalse San Roque, tomando muestras y analizando los distintos tipos de información obtenida. Estos datos son volcados en infografías que describen el estado del agua.

A la vez, y con el objetivo efectuar un seguimiento de las floraciones de cianobacterias de manera regional, también se realiza un monitoreo mediante imágenes satelitales. Estas imágenes se extraen del servidor de la Asociación Espacial Europea (ESA) y son capturadas con el satélite Sentinel 2. Este trabajo se complementa con las observaciones in situ.

Estos datos y mediciones permiten evaluar situaciones y definir acciones de mitigación para mantener en condiciones adecuadas el volumen de agua retenida en el embalse del Dique San Roque, que está tan expuesto a la influencia de las actividades humanas que se desarrollan en sus riberas y su cuenca.